首都医科大学附属北京中医医院药物临床试验机构有医疗器械临床试验专业科室37个，其中临床科室：消化科、肾病科、神经内科（针灸科）、心血管科、乳腺科、泌尿外科、疮疡外科、肿瘤外科、呼吸科、肛肠科、妇科、儿科、眼科、耳鼻喉科、口腔科、皮肤科、医疗美容科、肿瘤科、急诊医学科、麻醉科、疼痛科、重症医学科、内分泌科、男科、推拿科、健康管理部、心身医学科、感染科、老年病科、风湿病科、骨科；医技科室：临床检验科、病理科、核医学、超声诊断、心电图诊断、医学影像诊断。